RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PCYT1AP49585 367 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLDN18P56856 261 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLDN20P56880 219 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CXCR4P61073 352 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EFNB1P98172 346 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CDK5R2Q13319 367 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM99Q8N816 258 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OR10D3Q8NH80 312 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADGRG7Q96K78 797 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TAAR6Q96RI8 345 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TIMP4Q99727 224 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FN3KQ9H479 309 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLN6Q9NWW5 311 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RNF6Q9Y252 685 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C11orf98E9PRG8 122 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CXCL13O43927 109 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SYNGR4O95473 234 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PPP1R3DO95685 299 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TXNDC12O95881 172 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BCL10O95999 233 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IGHMP01871 453 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 F13BP05160 661 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF3P17036 446 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF43P17038 809 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SDHAP31040 664 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLDN15P56746 228 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ERVK-25P63136 954 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SRYQ05066 204 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KLRB1Q12918 225 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 POU4F3Q15319 338 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OCLNQ16625 522 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NADK2Q4G0N4 442 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SIAH3Q8IW03 269 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UEVLDQ8IX04 471 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GHDCQ8N2G8 530 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM163Q8TC26 289 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNX18Q96RF0 628 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CMC2Q9NRP2 79 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RASSF1Q9NS23 344 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 A6NIZ1 184 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF726A6NNF4 738 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AHRRA9YTQ3 701 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms