RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 CHAF1BQ13112 559 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DGUOKQ16854 277 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TP53I3Q53FA7 332 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MESTQ5EB52 335 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ACER2Q5QJU3 275 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 RAET1LQ5VY80 246 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SPINK14Q6IE38 97 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ARL9Q6T311 187 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 FAM122BQ7Z309 247 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ST8SIA1Q92185 356 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 UFD1Q92890 307 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ALG12Q9BV10 488 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SPRY4Q9C004 299 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 NUAK2Q9H093 628 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 INIPQ9NRY2 104 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MED29Q9NX70 200 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 FRYQ5TBA9 3013 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TRIM64BA6NI03 449 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 OR2T1O43869 369 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 NPIPB7O75200 414 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TFP02787 698 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CYC1P08574 325 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ICAM2P13598 275 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SLC2A5P22732 501 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DPP4P27487 766 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ACVR1BP36896 505 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 HTR3AP46098 478 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MLF1P58340 268 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SLC3A1Q07837 685 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ETFDHQ16134 617 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 OR6V1Q8N148 313 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 OR2M3Q8NG83 312 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SNX33Q8WV41 574 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ZNF649Q9BS31 505 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 EMC6Q9BV81 110 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 C12orf10Q9HB07 376 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MED13Q9UHV7 2174 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SSR3Q9UNL2 185 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 A0A0G2JMM0 328 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PPB8 328 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PRS3 328 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 IGHA1P01876 353 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CD63P08962 238 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SHC1P29353 583 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 OPRL1P41146 370 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CRYBB2P43320 205 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 RUNX1T1Q06455 604 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 LGALS3BPQ08380 585 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MYBPHQ13203 477 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SGCBQ16585 318 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 USP43Q70EL4 1123 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 BEST3Q8N1M1 668 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MCFD2Q8NI22 146 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DDIT4LQ96D03 193 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SERINC1Q9NRX5 453 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CD8B2A6NJW9 211 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PLPP3O14495 311 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DVL2O14641 736 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SLC16A7O60669 478 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TRAPPC6AO75865 159 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DKK1O94907 266 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MT-ATP6P00846 226 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 IGHEP01854 428 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PRKAR1AP10644 381 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CD8BP10966 210 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 IFNGR1P15260 489 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CPEP16870 476 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms