RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014		H7C1Q1	480 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0R1B8	84 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHP2	O43745	196 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFS7	O75251	213 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	INHBB	P09529	407 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF43	P17038	809 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFRSF1B	P20333	461 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDKN1A	P38936	164 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP5J2	P56134	94 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	VEZF1	Q14119	521 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TREML1	Q86YW5	311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2M2	Q96R28	347 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLPP3	O14495	311 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC22A2	O15244	555 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF74	Q16587	644 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMEL1	Q495T6	779 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	BIVM	Q86UB2	503 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF217	Q8TC41	542 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	RCN3	Q96D15	328 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	RADIL	Q96JH8	1075 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPYC	Q99645	322 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR35	Q9HC97	309 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CMTM6	Q9NX76	183 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A096LPE4	126 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PPZ6	126 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV4-39	P01824	125 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUT4	P22083	530 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTK	P33981	857 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRPS1	P60891	318 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUBA1B	P68363	451 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUBA4A	P68366	448 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	PUDP	Q08623	228 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC22A25	Q6T423	547 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUBA1A	Q71U36	451 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	CARM1	Q86X55	608 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SH3GL1	Q99961	368 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED29	Q9NX70	200 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC35F4	A4IF30	521 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP8B1	O43520	1251 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC43A1	O75387	559 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT33A	O76009	404 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	LY6G6D	O95868	133 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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