RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PSMG2Q969U7 264 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TLCD1Q96CP7 247 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PAGE5Q96GU1 130 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MS4A14Q96JA4 679 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OR5B2Q96R09 309 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RMND5AQ9H871 391 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MEAF6Q9HAF1 191 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GNG12Q9UBI6 72 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RNF14Q9UBS8 474 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RWDD2AQ9UIY3 292 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GUCA1BQ9UMX6 200 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SNX12Q9UMY4 172 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 VSIG4Q9Y279 399 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ALG6Q9Y672 507 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.26□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 DOCK8Q8NF50 2099 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TSC22D2O75157 780 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF254O75437 659 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SCRG1O75711 98 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 LRATO95237 230 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OPN1LWP04000 364 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 UQCRC2P22695 453 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ADORA2BP29275 332 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SSR1P43307 286 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 LIM2P55344 173 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 C2orf54Q08AI8 447 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SELPLGQ14242 412 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ITIH4Q14624 930 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ANGPT1Q15389 498 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ALX1Q15699 326 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 NDUFA9Q16795 377 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PAGE2BQ5JRK9 111 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CGB2Q6NT52 195 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GPR65Q8IYL9 337 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 IPMKQ8NFU5 416 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OSTF1Q92882 214 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TOP1MTQ969P6 601 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 SLC6A7Q99884 636 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ALG12Q9BV10 488 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 DUSP16Q9BY84 665 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OARD1Q9Y530 152 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC42Q9Y546 428 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ASB3Q9Y575 518 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.25□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MYH10P35580 1976 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ESYT2A0FGR8 921 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 DHRS7CA6NNS2 312 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 K7EQM0 130 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 TPST2O60704 377 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 KRT14P02533 472 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ALOX5P09917 674 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 FASP25445 335 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GCKP35557 465 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 HPCAL1P37235 193 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 OR3A4PP47883 348 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 STX17P56962 302 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 BCL2L1Q07817 233 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 GGTA1PQ4G0N0 100 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 CFAP157Q5JU67 520 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 LCE1FQ5T754 118 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ATAD3BQ5T9A4 648 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 ATF7IP2Q5U623 682 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 IFT20Q8IY31 132 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 UBALD2Q8IYN6 164 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1B-215ENST00000498054 MYOCDQ8IZQ8 938 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms