RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 FABP12A6NFH5 140 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PATE3B3GLJ2 98 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 E9PI62 339 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IMPA2O14732 288 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NDUFA2O43678 99 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SIGLEC6O43699 453 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CTNSO60931 367 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IL1AP01583 271 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CAPZBP47756 277 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 POU4F3Q15319 338 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RPTNQ6XPR3 784 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRR22Q8IZ63 422 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 VSTM2LQ96N03 204 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ALG8Q9BVK2 526 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 STRADBQ9C0K7 418 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FN3KQ9H479 309 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 Q9N2J8 555 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 V9GYH0 126 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 A0A0B4J2E0 115 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GX12 115 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPK0 400 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PQ09 198 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CDC14CA4D256 554 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 J3QLW9 94 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GABRPO00591 440 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 AK1P00568 194 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PLATP00750 562 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CT45A8P0DMV1 189 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CT45A9P0DMV2 189 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF19P17023 458 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 DRD5P21918 477 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GABRA5P31644 462 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ACVR1BP36896 505 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FOXL2P58012 376 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC3A1Q07837 685 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PYDC2Q56P42 97 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.4□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 STX12Q86Y82 276 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LNX2Q8N448 690 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TEAD3Q99594 435 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF559Q9BR84 538 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF649Q9BS31 505 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR10A5Q9H207 317 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ING3Q9NXR8 418 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GVC2 190 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 A6NIN4 97 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CHP2O43745 196 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HCN1O60741 890 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CD1CP29017 333 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RAB14P61106 215 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 S100A12P80511 92 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FAPQ12884 760 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 DDI2Q5TDH0 399 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HES3Q5TGS1 186 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IFI44Q8TCB0 444 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TSLPQ969D9 159 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SGTBQ96EQ0 304 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TCTN2Q96GX1 697 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.39□□□□□ -1.39
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