RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490705.1

ARF1-211, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARF1, Length 881 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-211ENST00000490705 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.76□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ABCD2Q9UBJ2 740 aa11.76□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.76□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 DPRXA6NFQ7 191 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 MS4A18H0YCH9 400 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 HS3ST1O14792 307 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 UPK3AO75631 287 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 SERPINI2O75830 405 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 DCTN3O75935 186 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 UMPSP11172 480 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 HLA-DOBP13765 273 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 AHCYP23526 432 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ZNF83P51522 516 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ZNF74Q16587 644 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 HMBOX1Q6NT76 420 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ADAM5Q6NVV9 412 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 KLHL24Q6TFL4 600 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 VTCN1Q7Z7D3 282 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 NKAIN4Q8IVV8 208 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PIGTQ969N2 578 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 FAM162AQ96A26 154 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ZNF426Q9BUY5 554 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 FKRPQ9H9S5 495 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 SPAG4Q9NPE6 437 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 NANSQ9NR45 359 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ADA2Q9NZK5 511 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 RIMS3Q9UJD0 308 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.75□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 C11orf98E9PRG8 122 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 M0R1B8 84 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PLPP3O14495 311 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ABCD4O14678 606 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ZNF432O94892 652 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 OR6A2O95222 327 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 SERPINA1P01009 418 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 HIST1H2ABP04908 130 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 IFNW1P05000 195 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ADORA3P0DMS8 318 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 NCK1P16333 377 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 IFNA8P32881 189 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 UGT2B15P54855 530 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 CARD17Q5XLA6 110 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 LINGO2Q7L985 606 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 WDR31Q8NA23 367 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PIK3C3Q8NEB9 887 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PFN4Q8NHR9 129 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 TMEM255BQ8WV15 326 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 FBXW5Q969U6 566 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 HSH2DQ96JZ2 352 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PRRC1Q96M27 445 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 OR2M2Q96R28 347 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 EMC6Q9BV81 110 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 LINC00470Q9BZP3 86 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 MED29Q9NX70 200 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ZNF229Q9UJW7 825 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ARID1AO14497 2285 aa11.74□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 SMPD2O60906 423 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 WNT11O96014 354 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 MT-ND1P03886 318 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 THRBP10828 461 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PTAFRP25105 342 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 YAP1P46937 504 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PRPS1P60891 318 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 SLC25A3Q00325 362 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ST3GAL3Q11203 375 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 IFI44LQ53G44 452 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 CBLL1Q75N03 491 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PXKQ7Z7A4 578 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 TMEM123Q8N131 208 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.73□□□□□ -0.53
ARF1-211ENST00000490705 RNF148Q8N7C7 305 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms