RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.58□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 UQCRHLA0A096LP55 91 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PP18 115 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 DUXAA6NLW8 204 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF716A6NP11 495 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 E7EQL1 145 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 GPRIN2O60269 458 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 UGT2B17O75795 530 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 LYZL6O75951 148 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 NUDT14O95848 222 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 AK1P00568 194 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 UBL4AP11441 157 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 TTKP33981 857 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 PGM1P36871 562 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 HPCAL1P37235 193 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 DIO1P49895 249 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 CLDN8P56748 225 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 H3F3AP84243 136 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 CBFBQ13951 182 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 MAPK14Q16539 360 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 SMU1Q2TAY7 513 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 IL23RQ5VWK5 629 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 C3orf33Q6P1S2 294 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 SZRD1Q7Z422 152 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 PHC2Q8IXK0 858 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR31Q8NA23 367 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC63Q8NA47 563 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5D16Q8NGK9 328 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 KIF18AQ8NI77 898 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 MUCL1Q96DR8 90 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 RADILQ96JH8 1075 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 MUS81Q96NY9 551 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 MECRQ9BV79 373 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC106Q9BWC9 280 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ATAD3AQ9NVI7 634 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM160Q9NX00 188 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ASIC5Q9NY37 505 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC17A7Q9P2U7 560 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 MID2Q9UJV3 735 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 FIS1Q9Y3D6 152 aa5.57□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 A8MV72 311 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ABCD4O14678 606 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 DNPH1O43598 174 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 KIAA0513O60268 411 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 STX11O75558 287 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 PMS2P2O95744 297 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 IFNA2P01563 188 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 G6PDP11413 515 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 GGT1P19440 569 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 PGCP20142 388 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 MATN1P21941 496 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 PTAFRP25105 342 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC7A1P30825 629 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 SERPINB5P36952 375 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 CDH11P55287 796 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 DSCR9P59020 149 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 VLDLRP98155 873 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 EMX2Q04743 252 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 FUT5Q11128 374 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 MERTKQ12866 999 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 STK11Q15831 433 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 GABRA6Q16445 453 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 NRF1Q16656 503 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 SYT14P1Q58G82 188 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 AGAP6Q5VW22 663 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 BHLHB9Q6PI77 547 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 OLIG3Q7RTU3 272 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 DDIASQ8IXT1 998 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 OR8J2Q8NGG1 315 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms