RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CD300A	Q9UGN4	299 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RASD1	Q9Y272	281 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS13C	Q709C8	3753 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WUJ7	227 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0B4J2E0	115 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GX12	115 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	DPRX	A6NFQ7	191 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CHP2	O43745	196 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	T-ENOL	P0DO92	83 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NTF4	P34130	210 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYBA2	P53672	197 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CEACAM7	Q14002	265 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRA6	Q16445	453 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	COMTD1	Q86VU5	262 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6S1	Q8NH40	331 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR14	Q9BWN1	585 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		15.21	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ROS1	P08922	2347 aa		15.21	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CIB4	A0PJX0	185 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5F1	O95221	314 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAU	P00749	431 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	THRB	P10828	461 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	EDNRA	P25101	427 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MPG	P29372	298 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1E2	P47887	323 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH12	P55289	794 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	BSPH1	Q075Z2	132 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR7A5	Q15622	319 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM225	Q6GV28	225 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DTX2	Q86UW9	622 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	UPB1	Q9UBR1	384 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		15.2	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RAMP1	O60894	148 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGA2	P17301	1181 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RY4	P51582	365 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ST3GAL3	Q11203	375 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TSC22D1	Q15714	1073 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NPTX1	Q15818	432 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MTX3	Q5HYI7	312 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CASP12	Q6UXS9	341 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM99	Q8N816	258 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	LRGUK	Q96M69	825 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	THTPA	Q9BU02	230 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		15.19	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPC2	O15144	300 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TPST2	O60704	377 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2AB	P04908	130 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF1B	P20333	461 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FAP	Q12884	760 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	STK11	Q15831	433 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	AAED1	Q7RTV5	226 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DHFR2	Q86XF0	187 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		15.18	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms