RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	TM9SF4	Q92544	642 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	PTP4A1	Q93096	173 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	HGD	Q93099	445 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	RELT	Q969Z4	430 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	OMA1	Q96E52	524 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	RAX2	Q96IS3	184 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6C1	Q96RD1	312 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX18	Q96RF0	628 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMP4	Q99727	224 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3GL3	Q99963	347 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	MED18	Q9BUE0	208 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	ASB6	Q9NWX5	421 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	STUB1	Q9UNE7	303 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4A-208	ENST00000489247	TECTA	O75443	2155 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PATE3	B3GLJ2	98 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN25	C9JDP6	229 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF4	O00268	1085 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SOCS6	O14544	535 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MYL12B	O14950	172 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FLRT2	O43155	660 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GPX5	O75715	221 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC2A10	O95528	541 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MT-ATP6	P00846	226 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CFI	P05156	583 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CD1A	P06126	327 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HEXB	P07686	556 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CD63	P08962	238 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF3	P17036	446 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FUT1	P19526	365 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PGC	P20142	388 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IL12B	P29460	328 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GABRA5	P31644	462 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	EVI2B	P34910	448 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IDUA	P35475	653 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HTR3A	P46098	478 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	P2RX1	P51575	399 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A1	P53007	311 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	EMP2	P54851	167 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NRG3	P56975	720 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTC1	P68032	377 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTA1	P68133	377 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF117	Q03924	483 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	EGR4	Q05215	589 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF846	Q147U1	533 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MED22	Q15528	200 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NNAT	Q16517	81 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF404	Q494X3	552 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CBLN3	Q6UW01	205 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HSDL2	Q6YN16	418 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM122B	Q7Z309	247 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ADCK1	Q86TW2	530 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CPO	Q8IVL8	374 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CADM2	Q8N3J6	435 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	AMER2	Q8N7J2	671 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF614	Q8N883	585 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	EXD3	Q8N9H8	876 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ST8SIA1	Q92185	356 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF524	Q96C55	264 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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