RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPHA1P21709 976 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK11Q15831 433 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYT9Q86SS6 491 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VN1R3Q9BXE9 311 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EMC9Q9Y3B6 208 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SELENOFO60613 162 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NID1P14543 1247 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAMLGP49069 296 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRI1Q9BV20 369 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.31■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMLR1H3BR10 107 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIGLEC6O43699 453 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST6GAL1P15907 406 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPTQ07507 201 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRSS45Q7RTY3 260 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEAD3Q99594 435 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FANCFQ9NPI8 374 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPX5O75715 221 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC2A1P11166 492 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCR6P51684 374 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR1D5P58170 312 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OTPQ5XKR4 325 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAXO2Q658L1 398 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLYATL2Q8WU03 294 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WBP1LQ9NX94 342 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HRGP04196 525 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCAF7P61962 342 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIMKLAQ8IXN7 391 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR5T1Q8NG75 326 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAT6Q93015 286 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLA2Q9H6Q3 261 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMED7Q9Y3B3 224 aa15.3■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VEGFCP49767 419 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATPIF1Q9UII2 106 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1QAP02745 245 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARL6IP1Q15041 203 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CADM3Q8N126 398 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR56B4Q8NH76 319 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIGCQ92535 297 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXL2Q9UKC9 423 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCM1Q15154 2024 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR5K3A6NET4 321 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDT1P36639 197 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HTR3AP46098 478 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BIDP55957 195 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C3P1Q6ZMU1 363 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEX19Q8NA77 164 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDH20Q9HBT6 801 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CORINQ9Y5Q5 1042 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8W036 122 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FABP7O15540 132 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGM4P49221 684 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BLOC1S1P78537 153 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NR0B2Q15466 257 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FCN2Q15485 313 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q499Y3 187 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OPN5Q6U736 354 aa15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms