RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CBFBQ13951 182 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 LIX1LQ8IVB5 337 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OR2T4Q8NH00 348 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 Q96M85 177 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ADOQ96SZ5 270 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 WACQ9BTA9 647 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 GNG8Q9UK08 70 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SPATA2Q9UM82 520 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0B4J293 547 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NPIPB7O75200 414 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 EDNRAP25101 427 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 MMP15P51511 669 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OR10A3P58181 314 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 GATSQ8NAP1 163 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF563Q8TA94 476 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 RFT1Q96AA3 541 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 RNF31Q96EP0 1072 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0G2JMP0 313 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0X1KG70 313 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PRG6 482 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OR6C70A6NIJ9 312 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TPPPO94811 219 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 UBL3O95164 117 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ABHD16AO95870 558 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 P2RX1P51575 399 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 HCCSP53701 268 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SHBQ15464 509 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CARTPTQ16568 116 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SAMD12Q8N8I0 201 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 STK35Q8TDR2 534 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TAAR8Q969N4 342 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF524Q96C55 264 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OMA1Q96E52 524 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 EXPH5Q8NEV8 1989 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 FZD7O75084 574 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF432O94892 652 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 SLC6A1P30531 599 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 NSDHLQ15738 373 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 MESTQ5EB52 335 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 COX15Q7KZN9 410 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 RNF138Q8WVD3 245 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 POU2F3Q9UKI9 436 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 ADAM10O14672 748 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFB5O43674 189 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 RENP00797 406 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2ABP04908 130 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 CYC1P08574 325 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 AHCYP23526 432 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 CFPP27918 469 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 DAB2P98082 770 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 SGCBQ16585 318 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 PTDSS2Q9BVG9 487 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 A8MUA0 341 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 UPK3AO75631 287 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 ATF1P18846 271 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 CXCR1P25024 350 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 ABCD3P28288 659 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 INPP1P49441 399 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 CCR4P51679 360 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 BLVRAP53004 296 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRF-212ENST00000477970 EFR3AQ14156 821 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms