RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FAM117AQ9C073 453 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CPED1A4D0V7 1026 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NDUFS4O43181 175 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FADS1O60427 444 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ST6GAL1P15907 406 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 BMP7P18075 431 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ADRA2CP18825 462 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MAPK8P45983 427 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 STX4Q12846 297 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 DECR1Q16698 335 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TMEM17Q86X19 198 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SMIM19Q96E16 107 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TCEAL4Q96EI5 215 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 JAM3Q9BX67 310 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 BCL2L10Q9HD36 194 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MED17Q9NVC6 651 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 A0A1W2PR48 441 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 AQP8O94778 261 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SOD2P04179 222 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CD3DP04234 171 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CSN2P05814 226 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CTSLP07711 333 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SIRPAP78324 504 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GABREP78334 506 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TAF13Q15543 124 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TSC22D1Q15714 1073 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 RAB12Q6IQ22 244 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NUDT13Q86X67 352 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CDS1Q92903 461 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CD180Q99467 661 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.29□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TGM5O43548 720 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MAS1P04201 325 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SELLP14151 372 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 Q6ZNB5 142 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SNX33Q8WV41 574 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SUSD6Q92537 303 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SLC35A4Q96G79 324 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 XKR8Q9H6D3 395 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 AHSPQ9NZD4 102 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MIOXQ9UGB7 285 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CACNA1HO95180 2353 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 M0QYG6 137 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 LATO43561 262 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ARL6IP5O75915 188 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZFPL1O95159 310 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 RPA2P15927 270 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 VAMP1P23763 118 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF136P52737 540 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PNLIPRP2P54317 469 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C17orf64Q86WR6 236 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 POFUT1Q9H488 388 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 EXO5Q9H790 373 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CMC2Q9NRP2 79 aa7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms