RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468108.1

CCDC66-211, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-211	ENST00000468108	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	OR8K3	Q8NH51	312 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	MR1	Q95460	341 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	TSLP	Q969D9	159 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	NUDT9	Q9BW91	350 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	MMP27	Q9H306	513 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108		U3KQV3	271 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	DMD	P11532	3685 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108		C9J4A7	227 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108		E9PQ18	207 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	AP3D1	O14617	1153 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	FFAR1	O14842	300 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	MAGEB3	O15480	346 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	MPZL2	O60487	215 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	FMO6P	O60774	539 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	STK17B	O94768	372 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	EPPIN	O95925	133 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	PTTG1	O95997	202 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	HTR1A	P08908	422 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	NAGA	P17050	411 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	TBXA2R	P21731	343 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	PRKACG	P22612	351 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	OPRL1	P41146	370 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	DAP	P51397	102 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	EFNA3	P52797	238 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	IST1	P53990	364 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	CDH12	P55289	794 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	IL5RA	Q01344	420 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	SPIB	Q01892	262 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF45	Q02386	682 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	DGCR6	Q14129	220 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	GALE	Q14376	348 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	TRAM2	Q15035	370 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	NPTX1	Q15818	432 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	MAPK14	Q16539	360 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	MEP1A	Q16819	746 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	DCST1	Q5T197	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCDC66-211	ENST00000468108	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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