RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466154.5

SLX4-202, Transcript of SLX4 structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLX4, Length 3,228 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4-202ENST00000466154 ZNF879B4DU55 563 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 WISP1O95388 367 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PRKCAP17252 672 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 GZMKP49863 264 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 GKN2Q86XP6 184 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 KDM8Q8N371 416 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 CUTCQ9NTM9 273 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PIN1P1O15428 100 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 CXCR1P25024 350 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 GDNFP39905 211 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 PRPS1P60891 318 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 CDONQ4KMG0 1287 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 LYPD8Q6UX82 237 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 CHIAQ9BZP6 476 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ZNF576Q9H609 170 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 STMN3Q9NZ72 180 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 SC5DO75845 299 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 CCR5P51681 352 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 HSD17B7P56937 341 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 FUT7Q11130 342 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 GAS6Q14393 721 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ZNF74Q16587 644 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 SLC36A2Q495M3 483 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 KLHL26Q53HC5 615 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 PMM1Q92871 262 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OR10A4Q9H209 315 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 KLK11Q9UBX7 282 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.89□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 SHISA7A6NL88 538 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OGG1O15527 345 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 SLC25A12O75746 678 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 GLCEO94923 617 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 CXCL3P19876 107 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 STOMP27105 288 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 BTCP35070 178 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 LTBQ06643 244 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 PLA1AQ53H76 456 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 NSMAFQ92636 917 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 UBL3O95164 117 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 CD14P08571 375 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 TAAR8Q969N4 342 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 FKBP7Q9Y680 259 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ZNF749O43361 778 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 MST1P26927 711 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 SLC37A1P57057 533 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 EGR4Q05215 589 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 SYS1Q8N2H4 156 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 MMP25Q9NPA2 562 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.88□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 C1QBP02746 253 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 UCHL1P09936 223 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 RORAP35398 523 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ADH7P40394 386 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 GPLD1P80108 840 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 PITPNAQ00169 270 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 RIN1Q13671 783 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 STPG1Q5TH74 334 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OR6V1Q8N148 313 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OR52I2Q8NH67 350 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 FOXQ1Q9C009 403 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OR51J1Q9H342 316 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.87□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms