RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCD3	P28288	659 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SHC1	P29353	583 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ACVR1B	P36896	505 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	AQP2	P41181	271 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RFX2	P48378	723 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	MMP15	P51511	669 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RAG2	P55895	527 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DLX5	P56178	289 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF117	Q03924	483 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZP2	Q05996	745 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNAB1	Q14722	419 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CD226	Q15762	336 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758		Q499Y3	187 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TP53I3	Q53FA7	332 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TSLP	Q969D9	159 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	INTS14	Q96SY0	518 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	LPAR4	Q99677	370 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	WAC	Q9BTA9	647 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	EMC3	Q9P0I2	261 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RASD1	Q9Y272	281 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	C5orf42	Q9H799	3197 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1B0GVT2	93 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758		B4DXG7	233 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF208	O43345	1280 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FADS1	O60427	444 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TF	P02787	698 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	BGLAP	P02818	100 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	YES1	P07947	543 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CLU	P10909	449 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	EPX	P11678	715 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FOLR1	P15328	257 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SPN	P16150	400 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ELK1	P19419	428 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SRM	P19623	302 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CCR9	P51686	369 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CLDN20	P56880	219 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZP4	Q12836	540 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FDX2	Q6P4F2	183 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC20B	Q86Y33	519 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A45	Q8N413	288 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	GATS	Q8NAP1	163 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	NSMAF	Q92636	917 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DDIT4L	Q96D03	193 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RASD2	Q96D21	266 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758		Q96M85	177 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	STMN3	Q9NZ72	180 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TTLL8	A6PVC2	850 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-222	ENST00000459758		K7ESF4	209 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-222	ENST00000459758	AIP	O00170	330 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-222	ENST00000459758	SUSD5	O60279	629 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-222	ENST00000459758	ALOX12B	O75342	701 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-222	ENST00000459758	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-222	ENST00000459758	PSKH1	P11801	424 aa		10.45	□□□□□ -0.74

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