RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 GH1P01241 217 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 IL2RAP01589 272 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV3-30P01768 117 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV3-33P01772 117 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 HLA-DQA1P01909 254 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FHP07954 510 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00869P0C866 280 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CCL3P10147 92 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 S1PR1P21453 382 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GIFP27352 417 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ALDH3A1P30838 453 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 LSP1P33241 339 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PPICP45877 212 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CSNK1A1P48729 337 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 POLD2P49005 469 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 VAMP7P51809 220 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PKNOX1P55347 436 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00310P59036 64 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 KCNJ2P63252 427 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FAM160A1Q05DH4 1040 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CHRNDQ07001 517 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TRDNQ13061 729 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 STX5Q13190 355 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MTMR2Q13614 643 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CUL1Q13616 776 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CRMP1Q14194 572 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PDGFRLQ15198 375 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 DHCR24Q15392 516 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR7A5Q15622 319 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 DECR1Q16698 335 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GFOD2Q3B7J2 385 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 COBLL1Q53SF7 1204 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 XKR9Q5GH70 373 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR2B11Q5JQS5 317 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 EFHC1Q5JVL4 640 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SLC35D3Q5M8T2 416 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GPR107Q5VW38 600 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FAM71E1Q6IPT2 247 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FAM72DQ6L9T8 149 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ACSM6Q6P461 480 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TBPL2Q6SJ96 375 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TMCO3Q6UWJ1 677 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 UGT2A3Q6UWM9 527 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CES3Q6UWW8 571 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 RAD9BQ6WBX8 426 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MACC1Q6ZN28 852 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SLC24A5Q71RS6 500 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 KDELC2Q7Z4H8 507 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD37Q7Z713 158 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MORC1Q86VD1 984 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GLB1L2Q8IW92 636 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FTMTQ8N4E7 242 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM251Q8N6I4 163 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD44Q8N8A2 993 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SPERTQ8NA61 448 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF680Q8NEM1 530 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 LPCAT1Q8NF37 534 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR1J1Q8NGS3 322 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR9A1PQ8NGU1 263 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR10D3Q8NH80 312 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SNX29Q8TEQ0 813 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 UBASH3BQ8TF42 649 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM239Q8WW34 195 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TANKQ92844 425 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SDCCAG3Q96C92 435 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 RCN3Q96D15 328 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FAHD2AQ96GK7 314 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR1F2PQ96R84 312 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR6C1Q96RD1 312 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TEAD3Q99594 435 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TXNDC17Q9BRA2 123 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GGACTQ9BVM4 153 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SPZ1Q9BXG8 430 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TTTY12Q9BZ98 90 aa-2.39□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP-2.39□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms