RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF583Q96ND8 569 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 RCE1Q9Y256 329 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CADP27708 2225 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TRAPPC13A5PLN9 417 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 MS4A18H0YCH9 400 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ATP8B1O43520 1251 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 FZD7O75084 574 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 DANCRP0C864 163 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 HLA-DOBP13765 273 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 PGGHGQ32M88 737 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 MS4A18Q3C1V0 323 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TBRG1Q3YBR2 411 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 WDR88Q6ZMY6 472 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CARM1Q86X55 608 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 OR6S1Q8NH40 331 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 RADILQ96JH8 1075 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SMR3AQ99954 134 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 FAM107BQ9H098 131 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 MTORP42345 2549 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM64A6NGJ6 449 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM64BA6NI03 449 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SLC22A2O15244 555 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC22O60826 627 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF432O94892 652 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 THY1P04216 161 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 FOSL1P15407 271 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 RIPPLY3P57055 190 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TUBA1BP68363 451 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TUBA4AP68366 448 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 PRSS57Q6UWY2 283 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 DEF8Q6ZN54 512 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TUBA1AQ71U36 451 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SCAIQ8N9R8 606 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 OR2T12Q8NG77 320 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 EMC6Q9BV81 110 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 LINC00470Q9BZP3 86 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 FAIMQ9NVQ4 179 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 BAG5Q9UL15 447 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ATP23Q9Y6H3 246 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 FAM220BPB1ANY3 271 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 C11orf98E9PRG8 122 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 H7C1Q1 480 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TMCC2O75069 709 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 CH25HO95992 272 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 IFNA14P01570 189 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 INHBBP09529 407 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 COX4I1P13073 169 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 PUDPQ08623 228 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 VEZF1Q14119 521 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 PIK3C3Q8NEB9 887 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 SLC41A3Q96GZ6 507 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 OR2M2Q96R28 347 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 MED29Q9NX70 200 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 USF3Q68DE3 2245 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 E7EQL1 145 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 M0R3G1 203 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 OR6A2O95222 327 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 LYPD3O95274 346 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 ADORA3P0DMS8 318 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 OR1E2P47887 323 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TAS2R41P59536 307 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 LINC00114Q6XXX2 140 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TPD52L3Q96J77 140 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 CRLF2Q9HC73 371 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 GPR35Q9HC97 309 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 PLPP3O14495 311 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 MT-ATP6P00846 226 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 UMPSP11172 480 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 SEC24CP53992 1094 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 ARF1P84077 181 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 CEACAM16Q2WEN9 425 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 CYBRD1Q53TN4 286 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 B3GLCTQ6Y288 498 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 Q71RC1 249 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA21Q7Z572 469 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 MICU2Q8IYU8 434 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 OR5J2Q8NH18 312 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TXNDC15Q96J42 360 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 BDH2Q9BUT1 245 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 FKRPQ9H9S5 495 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 NOX1Q9Y5S8 564 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-210ENST00000440825 ELOVL7A1L3X0 281 aa24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms