RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS5P46782 204 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSTNP60981 165 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL1RL1Q01638 556 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGR4Q05215 589 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RUNX1T1Q06455 604 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAG1Q14118 895 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.37□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL17RDQ8NFM7 739 aa11.37□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC14L2O76054 403 aa11.36□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.36□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.36□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMAHPQ9Y471 501 aa11.36□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR45Q9Y5Y3 372 aa11.36□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R233 179 aa11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIM2O14862 343 aa11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VENTXO95231 258 aa11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBX1P83916 185 aa11.35□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.35□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2M2Q96R28 347 aa11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.35□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa11.35□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT52Q9Y366 437 aa11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TENM1Q9UKZ4 2725 aa11.35□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0A6YYJ9 748 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JPF8 293 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM247A6NEH6 219 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.34□□□□□ -0.59
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLCO1B7G3V0H7 640 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNGR3O43761 229 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T1O43869 369 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANP32DO95626 131 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL6P05231 212 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR4A1P22736 598 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EVX1P49640 407 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXC5Q00444 222 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX3Q13277 289 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSMPQ1L6U9 139 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT71Q3SY84 523 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTDC1Q4AE62 458 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF311Q5JNZ3 666 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM69AQ5T7M9 428 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC38A4Q969I6 547 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35B4Q969S0 331 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf10Q9HB07 376 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GNT2Q9NY97 397 aa11.34□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R3G1 203 aa11.33□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
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