RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 BEST4Q8NFU0 473 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 CCL4L1Q8NHW4 92 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 BCORQ6W2J9 1755 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPN6P29350 595 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 LCN10Q6JVE6 187 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 MAFIPQ8WZ33 124 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PLSCR5A0PG75 271 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 P2RX6O15547 441 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 FGF17O60258 216 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PEX11BO96011 259 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ISL1P61371 349 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52N1Q8NH53 320 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 SLA2Q9H6Q3 261 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB9BQ9NP90 201 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAPPC2LH3BP13 241 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 LIPAP38571 399 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 CX3CR1P49238 355 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 NRARPQ7Z6K4 114 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 OR1S1Q8NH92 325 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PFN4Q8NHR9 129 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 CLEC2DQ9UHP7 191 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPAN12O95859 305 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ALDH3B2P48448 385 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 LGALS14Q8TCE9 139 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 RASD2Q96D21 266 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 BDKRB2P30411 391 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 Q96M85 177 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM68Q96MH6 324 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL9Q9H1A3 318 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ST6GAL1P15907 406 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 HTR2CP28335 458 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 CCR5P51681 352 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNAB1Q14722 419 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf140Q5VVS0 124 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF18BQ86Y91 864 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4M1Q8NGD0 313 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 IL1F10Q8WWZ1 152 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 MEP1BQ16820 701 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00346Q8IVM7 164 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 OR14A2Q96R54 314 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PIGQQ9BRB3 760 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A087WUU8 490 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF25A6NGN4 478 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 MZT1Q08AG7 82 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 MFAP5Q13361 173 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 SSC5DA1L4H1 1573 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 DOCK2Q92608 1830 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2A25A4D2G3 310 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 THBS1P07996 1170 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM196Q5HYL7 178 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 OR7G2Q8NG99 324 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 C17orf50Q8WW18 174 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 EMC9Q9Y3B6 208 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 DDAH2O95865 285 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00696Q6ZRV3 163 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 COMMD7Q86VX2 200 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 OBP2BQ9NPH6 170 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 WASH6PQ9NQA3 447 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 B3GNT2Q9NY97 397 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf72A6NCS6 295 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 TCN2P20062 427 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 RRADP55042 308 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 MTCP1P56278 107 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 GRINAQ7Z429 371 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2M2Q96R28 347 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 IKZF5Q9H5V7 419 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 EHFQ9NZC4 300 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 TNFSF4P23510 183 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVK-16P61578 105 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GTL3 188 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM64CA6NLI5 447 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAM23O75077 832 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 FCGR2AP12318 317 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 BSGP35613 385 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 CARD18P57730 90 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR176Q14439 515 aa19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms