RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PXKQ7Z7A4 578 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC17Q8N6Y2 441 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF148Q8N7C7 305 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR31Q8NA23 367 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM255BQ8WV15 326 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 MBD6Q96DN6 1003 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNDC15Q96J42 360 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 HS6ST2Q96MM7 605 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXC2Q99958 501 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00470Q9BZP3 86 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FKRPQ9H9S5 495 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 EGFL7Q9UHF1 273 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 A4GNTQ9UNA3 340 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 NOX1Q9Y5S8 564 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A15Q9Y619 301 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 OTOGQ6ZRI0 2925 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF587BE7ETH6 402 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 MT-ND1P03886 318 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2ABP04908 130 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CD3EP07766 207 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ADORA3P0DMS8 318 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNA8P32881 189 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM34P42696 430 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 YAP1P46937 504 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ST3GAL3Q11203 375 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT72Q14CN4 511 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 IFI44LQ53G44 452 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 LINGO2Q7L985 606 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FITM2Q8N6M3 262 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM239Q8WW34 195 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2ACQ93077 130 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CDRT15Q96T59 188 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC17A5Q9NRA2 495 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TAS2R5Q9NYW4 299 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF229Q9UJW7 825 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAM21Q9UKJ8 722 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX13Q9Y5W8 968 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP9Q99996 3911 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO9AB2RTY4 2548 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf98E9PRG8 122 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CLOCKO15516 846 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 GMNNO75496 209 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNW1P05000 195 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 UGT2B15P54855 530 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 BSPH1Q075Z2 132 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ZP4Q12836 540 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB113Q30KQ7 82 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 HMBOX1Q6NT76 420 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 C17orf78Q8N4C9 275 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC197Q8NCU1 140 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PFN4Q8NHR9 129 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 HSH2DQ96JZ2 352 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PRRC1Q96M27 445 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2M2Q96R28 347 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 EMC6Q9BV81 110 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 NPAP1Q9NZP6 1156 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS6KA6Q9UK32 745 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF115Q9Y4L5 304 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC168Q8NDH2 2452 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP6Q13023 2319 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35F4A4IF30 521 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF726A6NNF4 738 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 J3KTA2 159 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 UMPSP11172 480 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 FUT1P19526 365 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MNAT1P51948 309 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CARD17Q5XLA6 110 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR137CQ8N3F9 429 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3C3Q8NEB9 887 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SGTBQ96EQ0 304 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 BOD1Q96IK1 185 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 NSL1Q96IY1 281 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 FNDC11Q9BVV2 318 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CXXC4Q9H2H0 198 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MED29Q9NX70 200 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 RHCGQ9UBD6 479 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CD300AQ9UGN4 299 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MED31Q9Y3C7 131 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 FFAR1O14842 300 aa18.5■□□□□ 0.55
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