RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MALT1Q9UDY8 824 aa13.61□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS50Q9UI38 385 aa13.61□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TESMINQ9Y4I5 508 aa13.61□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRN3E7EW58 273 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MS4A18H0YCH9 400 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 J3KTA2 159 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 hCG_2039718K7EN88 272 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC43A1O75387 559 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 OR7A10O76100 309 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-9P01782 118 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ASAH2BP0C7U1 165 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 IFI30P13284 250 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN17P56750 224 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TLE4Q04727 773 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ZP4Q12836 540 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MS4A18Q3C1V0 323 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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PGGT1B-202ENST00000379615 ANKK1Q8NFD2 765 aa13.6□□□□□ -0.23
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PGGT1B-202ENST00000379615 HSD17B8Q92506 261 aa13.6□□□□□ -0.23
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PGGT1B-202ENST00000379615 BPIFA2Q96DR5 249 aa13.6□□□□□ -0.23
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PGGT1B-202ENST00000379615 ACTR6Q9GZN1 396 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MCCC2Q9HCC0 563 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC14L4Q9UDX3 406 aa13.6□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CIB4A0PJX0 185 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF726A6NNF4 738 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF13O43567 381 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS23O95084 383 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SEMG1P04279 462 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V1B2P21281 511 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 NTF4P34130 210 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 VLDLRP98155 873 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CHRNB3Q05901 458 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 FAPQ12884 760 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKDD1AQ495B1 522 aa13.59□□□□□ -0.23
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PGGT1B-202ENST00000379615 FBXW10Q5XX13 1052 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD34AQ69YU3 496 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 NIPAL3Q6P499 406 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa13.59□□□□□ -0.23
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa13.59□□□□□ -0.23
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PGGT1B-202ENST00000379615 PFN4Q8NHR9 129 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CLPTM1LQ96KA5 538 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SEPHS2Q99611 448 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 NDEL1Q9GZM8 345 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGIXQ9H6Y5 334 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 NGBQ9NPG2 151 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC7A10Q9NS82 523 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 C20orf141Q9NUB4 165 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TAS2R16Q9NYV7 291 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM5Q9Y2B1 443 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ROS1P08922 2347 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CREBBPQ92793 2442 aa13.59□□□□□ -0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WUU8 490 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 A6NNC1 897 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF587BE7ETH6 402 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT36O76013 467 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 HPRP00739 348 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 SAGP10523 405 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 COX5AP20674 150 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV1-2P23083 117 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 MPGP29372 298 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CCKARP32238 428 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 SELENOPP49908 381 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 MS4A2Q01362 244 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKCDQ05655 676 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF11Q15544 211 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPO2Q5TGU0 170 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 HDDC2Q7Z4H3 204 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC17Q8N6Y2 441 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 S100PBPQ96BU1 408 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 MUCL1Q96DR8 90 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00470Q9BZP3 86 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TAS2R5Q9NYW4 299 aa13.58□□□□□ -0.24
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