RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 SHC1P29353 583 aa22.05■■□□□ 1.12
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ECHDC3-201ENST00000379215 MVKQ03426 396 aa22.05■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 CRMP1Q14194 572 aa22.05■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 PDSS1Q5T2R2 415 aa22.05■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 NIPAL3Q6P499 406 aa22.05■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 OR4K13Q8NH42 304 aa22.05■■□□□ 1.12
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ECHDC3-201ENST00000379215 SEC14L4Q9UDX3 406 aa22.05■■□□□ 1.12
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ECHDC3-201ENST00000379215 FAM166BA8MTA8 275 aa22.04■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 MKRN2OSH3BPM6 223 aa22.04■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 XKRYO14609 159 aa22.04■■□□□ 1.12
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ECHDC3-201ENST00000379215 Q96M85 177 aa22.04■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 ERVK-18Q9QC07 812 aa22.04■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 NOX1Q9Y5S8 564 aa22.04■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 A6NIZ1 184 aa22.03■■□□□ 1.12
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ECHDC3-201ENST00000379215 RAP1AP62834 184 aa22.03■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 ST3GAL4Q11206 333 aa22.03■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC10A1Q14973 349 aa22.03■■□□□ 1.12
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ECHDC3-201ENST00000379215 SIGLEC11Q96RL6 698 aa22.03■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 TIGARQ9NQ88 270 aa22.03■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 RASD1Q9Y272 281 aa22.03■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa22.02■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 MS4A18H0YCH9 400 aa22.02■■□□□ 1.12
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ECHDC3-201ENST00000379215 HTR1AP08908 422 aa22.02■■□□□ 1.12
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ECHDC3-201ENST00000379215 AKAP13Q12802 2813 aa22.02■■□□□ 1.12
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM183AA6NL82 134 aa22.02■■□□□ 1.11
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ECHDC3-201ENST00000379215 RENP00797 406 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC25A1P53007 311 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC35D3Q5M8T2 416 aa22.02■■□□□ 1.11
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ECHDC3-201ENST00000379215 NPEPL1Q8NDH3 523 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 RELTQ969Z4 430 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 RNFT2Q96EX2 444 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM80Q96HE8 168 aa22.02■■□□□ 1.11
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ECHDC3-201ENST00000379215 SPTBN2O15020 2390 aa22.01■■□□□ 1.11
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ECHDC3-201ENST00000379215 ACTL6AO96019 429 aa22.01■■□□□ 1.11
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ECHDC3-201ENST00000379215 C19orf57Q0VDD7 668 aa22.01■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 BCL2A1Q16548 175 aa22.01■■□□□ 1.11
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ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM99Q8N816 258 aa22.01■■□□□ 1.11
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ECHDC3-201ENST00000379215 SGCDQ92629 289 aa22.01■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 FCGR1BQ92637 280 aa22.01■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 PTP4A1Q93096 173 aa22.01■■□□□ 1.11
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ECHDC3-201ENST00000379215 NMNAT3Q96T66 252 aa22.01■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 RHNO1Q9BSD3 238 aa22.01■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa22.01■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 CSAG2Q9Y5P2 127 aa22.01■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 TNFSF11O14788 317 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 SERPINI2O75830 405 aa22■■□□□ 1.11
ECHDC3-201ENST00000379215 FADS2O95864 444 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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