RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 RPTNQ6XPR3 784 aa26.41■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC103Q8IW40 242 aa26.41■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 OR5J2Q8NH18 312 aa26.41■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CLCF1Q9UBD9 225 aa26.41■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa26.41■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SLC22A20A6NK97 555 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SOX14O95416 240 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H2ABP04908 130 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 PTGER4P35408 488 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CXCR4P61073 352 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CDK5R2Q13319 367 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 C6orf141Q5SZD1 244 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 RTL6Q6ICC9 239 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 OAFQ86UD1 273 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 KIF18BQ86Y91 864 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SCAIQ8N9R8 606 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 GALNT11Q8NCW6 608 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 OR13C2Q8NGS9 318 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H2ACQ93077 130 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 PRRG4Q9BZD6 226 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A19Q9HC21 320 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CHST11Q9NPF2 352 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 OSGIN2Q9Y236 505 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF175Q9Y473 711 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 FAM215AQ9Y5M1 114 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa26.4■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 MPZL2O60487 215 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 AQP8O94778 261 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 TGM6O95932 706 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 POU1F1P28069 291 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CDK5Q00535 292 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 PMS2P3Q13401 168 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf185Q5T7R7 199 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf73Q69YU5 71 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF620Q6ZNG0 422 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 FCRLAQ7L513 359 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ENTHD1Q8IYW4 607 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 FAM81AQ8TBF8 368 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF566Q969W8 418 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CDH10Q9Y6N8 788 aa26.39■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 UNC119BA6NIH7 251 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 AQP7P3A6NL99 342 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 RAMP1O60894 148 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 GIPRP48546 466 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 SLC9A3P48764 834 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 P2RY4P51582 365 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM154Q6P9G4 183 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 OR51A7Q8NH64 312 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 TEX47Q8TBZ9 253 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 CALHM2Q9HA72 323 aa26.39■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV27A0A087WT01 109 aa26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 P4HA3Q7Z4N8 544 aa26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 SLC43A2Q8N370 569 aa26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 RPRMLQ8N4K4 120 aa26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 RHOXF1Q8NHV9 184 aa26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 IMPAD1Q9NX62 359 aa26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL13Q9P2N7 655 aa26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 RNF6Q9Y252 685 aa26.38■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 CD8B2A6NJW9 211 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 PLPP3O14495 311 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC159P0C7I6 412 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 SMSP52788 366 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 CASP6P55212 293 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 FHL1Q13642 323 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM225Q6GV28 225 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 LAIR2Q6ISS4 152 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 KDM8Q8N371 416 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 RNF128Q8TEB7 428 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 BLOC1S6Q9UL45 172 aa26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 ADORA3P0DMS8 318 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 FCGR2AP12318 317 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 CSNK2BP67870 215 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM236Q5W0B7 351 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 SLC27A4Q6P1M0 643 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD3Q8WU67 409 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 WNT2BQ93097 391 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 EGLN3Q9H6Z9 239 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R5Q9NYW4 299 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 HIF3AQ9Y2N7 669 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 NBASA2RRP1 2371 aa26.36■■□□□ 1.81
ECHS1-201ENST00000368547 MS4A18H0YCH9 400 aa26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms