RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SOD3P08294 240 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 HSD17B1P14061 328 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PAX1P15863 534 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MPGP29372 298 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GZMMP51124 257 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF83P51522 516 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TGFBR3Q03167 851 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 EGR4Q05215 589 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 DMTNQ08495 405 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MTX3Q5HYI7 312 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM225Q6GV28 225 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ULK3Q6PHR2 472 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 BIVMQ86UB2 503 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC38A4Q969I6 547 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C18orf12Q96KH6 178 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 Q96MF0 132 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 EPYCQ99645 322 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf21Q9H246 121 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CMTM6Q9NX76 183 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RASD1Q9Y272 281 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0B4J2E0 115 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GX12 115 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 B2RBV5 119 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SHISA9B4DS77 424 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 H7C1Q1 480 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 M0R082 166 aa6.72□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 CXCR6O00574 342 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NME4O00746 187 aa6.72□□□□□ -1.33
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SGMS1-201ENST00000361543 OPN1SWP03999 348 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 INHBBP09529 407 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 DANCRP0C864 163 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 THRBP10828 461 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CD247P20963 164 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PTAFRP25105 342 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GRPRP30550 384 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 KDELR2P33947 212 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GSK3BP49841 420 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SELENOPP49908 381 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5J2P56134 94 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A3Q00325 362 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LGALS3BPQ08380 585 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SPOCK1Q08629 439 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NRF1Q16656 503 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PGGHGQ32M88 737 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NIPAL3Q6P499 406 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF613Q6PF04 617 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SMYD1Q8NB12 490 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RNF217Q8TC41 542 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TAAR8Q969N4 342 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FAM162AQ96A26 154 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MPP4Q96JB8 637 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MUS81Q96NY9 551 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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