RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
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SPNS3-201ENST00000355530 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ACOT7O00154 380 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
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SPNS3-201ENST00000355530 Q6ZTK2 550 aa16.64■□□□□ 0.25
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SPNS3-201ENST00000355530 C16orf52Q8NHV5 167 aa16.63■□□□□ 0.25
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SPNS3-201ENST00000355530 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
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SPNS3-201ENST00000355530 UPK3AO75631 287 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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SPNS3-201ENST00000355530 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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SPNS3-201ENST00000355530 OR10A5Q9H207 317 aa16.62■□□□□ 0.25
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SPNS3-201ENST00000355530 MGAT4CQ9UBM8 478 aa16.62■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 NUP50Q9UKX7 468 aa16.62■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa16.62■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa16.62■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 LINC01565O15544 149 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ABHD16AO95870 558 aa16.61■□□□□ 0.25
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