RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HMGN1P05114 100 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CD2P06729 351 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RFPL3SP0C7P2 107 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ERGP11308 486 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF1BP20333 461 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CAPN3P20807 821 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RAP1BP61224 184 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RAP1AP62834 184 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR1Q1Q15612 314 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CAMKMTQ7Z624 323 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FAM156AQ8NDB6 213 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CACNG6Q9BXT2 260 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LAT2Q9GZY6 243 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MS4A5Q9H3V2 200 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GPR52Q9Y2T5 361 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MEMO1Q9Y316 297 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0A6YYD5 115 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 HSPA12AO43301 675 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SOX14O95416 240 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 FBXO45P0C2W1 286 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 EPXP11678 715 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CD1EP15812 388 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MST1P26927 711 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 RAC3P60763 192 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 RAB39AQ14964 217 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 VMACQ2NL98 169 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LEG1Q6P5S2 330 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 GPR27Q9NS67 375 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MED29Q9NX70 200 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 COL4A2P08572 1712 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35F4A4IF30 521 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf49A4QMS7 147 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FITM1A5D6W6 292 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ATP1B1P05026 303 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PTAFRP25105 342 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 AQP2P41181 271 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GSK3BP49841 420 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C21orf58P58505 322 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 COX15Q7KZN9 410 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 NDNFQ8TB73 568 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM239Q8WW34 195 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 STON2Q8WXE9 905 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MICU1Q9BPX6 476 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TREM2Q9NZC2 230 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RASD1Q9Y272 281 aa3.99□□□□□ -1.77
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