RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB1Q9Y576 335 aa15.06■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 ACOD1A6NK06 481 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 VAMP5O95183 116 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 SCG5P05408 212 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP11P24347 488 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 BDKRB2P30411 391 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 MTCP1P56278 107 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB31Q13636 194 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 SULF2Q8IWU5 870 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 MORN4Q8NDC4 146 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 OR56B1Q8NGI3 324 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF128Q8TEB7 428 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPOQ9BU64 300 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 F5H5P2 479 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 DSCR3O14972 297 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 GLSO94925 669 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM23P36406 574 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 PLGLAQ15195 96 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 FCRLAQ7L513 359 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 OLIG3Q7RTU3 272 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.05■□□□□ 0
SH3BP4-201ENST00000344528 LILRA5A6NI73 299 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGN4O00479 90 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 GABREP78334 506 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM4DQ6B0I6 523 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 B3GLCTQ6Y288 498 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRG2P18507 467 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 IL2RGP31785 369 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 D6RAR5 112 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX11BO96011 259 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 F10P00742 488 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 TFP02787 698 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 TK1P04183 234 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 OR11L1Q8NGX0 322 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52N1Q8NH53 320 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1S1Q8NH92 325 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35A4Q96G79 324 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 PBDC1Q9BVG4 233 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNA9Q9UGM1 479 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 SOCS6O14544 535 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC34A2O95436 690 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM59Q9BXS4 323 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF286AQ9HBT8 521 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 NOX4Q9NPH5 578 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A087WV62 115 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 GLCEO94923 617 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 VWA2Q5GFL6 755 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 NPSR1Q6W5P4 371 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 PDZD9Q8IXQ8 264 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 CA13Q8N1Q1 262 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 ITPKCQ96DU7 683 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF285Q96NJ3 590 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC14L2O76054 403 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 PAHP00439 452 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 TPOP07202 933 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 BSGP35613 385 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R46P59540 309 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 OR7G2Q8NG99 324 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 RREB1Q92766 1687 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 TFAP2AP05549 437 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-DMAP28067 261 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR3P46089 330 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 MEP1BQ16820 701 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF511Q8NB15 262 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 GJC3Q8NFK1 279 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 Q96M85 177 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR14Q9BWN1 585 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51J1Q9H342 316 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 MUTYHQ9UIF7 546 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PQ09 198 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP4-201ENST00000344528 MEIS3P1A6NDR6 274 aa15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms