RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 E2F1Q01094 437 aa16.15■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.186e-18■□□□□ 8.9
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ACTB-201ENST00000331789 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 NCDNQ9UBB6 729 aa16.13■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 SYT4Q9H2B2 425 aa16.13■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 SHISA3A0PJX4 238 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 TVP23AA6NH52 213 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 MS4A18H0YCH9 400 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 H3BML4 177 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 ZNF208O43345 1280 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 OPN1LWP04000 364 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 CD63P08962 238 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 IMPDH2P12268 514 aa16.12■□□□□ 0.17
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