RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR14I1A6ND48 311 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIIAD1A6NNX1 92 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPA2E9PIF3 369 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPA3F8WFD2 350 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 VAMP5O95183 116 aa24.54■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C3AR1Q16581 482 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST3GAL2Q16842 350 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR139Q6DWJ6 353 aa24.54■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ARPC3O15145 178 aa24.53■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM14Q9GZV8 571 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 TXNIPQ9H3M7 391 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 FANCFQ9NPI8 374 aa24.52■■□□□ 1.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF814B7Z6K7 855 aa24.51■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF3P17036 446 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISL1P61371 349 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 LY6DQ14210 128 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCRLAQ7L513 359 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENTHD1Q8IYW4 607 aa24.51■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CMC2Q9NRP2 79 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL13Q9P2N7 655 aa24.51■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa24.51■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35D2Q76EJ3 337 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 JAZF1Q86VZ6 243 aa24.51■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PON3Q15166 354 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM122BQ7Z309 247 aa24.5■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-201ENST00000318988 WBP1Q96G27 269 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBA1CQ9BQE3 449 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLN6Q9NWW5 311 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF226Q9NYT6 803 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 B3GAT1Q9P2W7 334 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF407Q9C0G0 2248 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPB13A6NJU9 1138 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTLL8A6PVC2 850 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPB4C9JG80 1138 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAMP1O60894 148 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 TXNDC12O95881 172 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTGS2P35354 604 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACVR1BP36896 505 aa24.49■■□□□ 1.51
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