RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CMC2Q9NRP2 79 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 MED17Q9NVC6 651 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 DNAJC13O75165 2243 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 MYL12BO14950 172 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 HMGN1P05114 100 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 LIMS3P0CW19 117 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 LIMS4P0CW20 117 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 MELKQ14680 651 aa9.93□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 TEAD3Q99594 435 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 TEX12Q9BXU0 123 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 PLA2G3Q9NZ20 509 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.93□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 WIF1Q9Y5W5 379 aa9.93□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 SLC35F4A4IF30 521 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 H0YC42 278 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RAB36O95755 333 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 PRKAR1AP10644 381 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CBX5P45973 191 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SLC6A8P48029 635 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RGS6P49758 472 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SPHARQ15513 63 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 NTRK2Q16620 822 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 C1orf140Q5VVS0 124 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SPINK14Q6IE38 97 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 LEG1Q6P5S2 330 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 OPALINQ96PE5 141 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 HES7Q9BYE0 225 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 RACGAP1Q9H0H5 632 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 C12orf71A8MTZ7 269 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 DVL2O14641 736 aa9.92□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 AIREO43918 545 aa9.92□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 DKK1O94907 266 aa9.92□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 SSX6Q7RTT6 188 aa9.92□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 OR8K3Q8NH51 312 aa9.92□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2ACQ93077 130 aa9.92□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 BEST3Q8N1M1 668 aa9.91□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.91□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.91□□□□□ -0.82
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GGPS1-201ENST00000282841 SELENOFO60613 162 aa9.91□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 AKR7A3O95154 331 aa9.91□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
GGPS1-201ENST00000282841 HTR1FP30939 366 aa9.91□□□□□ -0.82
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