RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 DCDC2BA2VCK2 349 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 DUX1O43812 170 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PLGP00747 810 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 FBXO45P0C2W1 286 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ILKQ13418 452 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OR5I1Q13606 314 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 DHCR24Q15392 516 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OVCH2Q7RTZ1 564 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OR52I1Q8NGK6 324 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 WDFY2Q96P53 400 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 IL26Q9NPH9 171 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CA14Q9ULX7 337 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 BLACEA4D250 179 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TNFSF12O43508 249 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM127O75204 238 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 H2AFB1P0C5Y9 115 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CR2P20023 1033 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 AMZ1Q400G9 498 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 LCTLQ6UWM7 567 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 FAM24BQ8N5W8 94 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC15Q8TF66 581 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PHYHIPQ92561 330 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 NICN1Q9BSH3 213 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 KLRF1Q9NZS2 232 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 KCNG2Q9UJ96 466 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ERVH48-1M5A8F1 160 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 IFITM2Q01629 132 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TAS2R5Q9NYW4 299 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PQLC2LA1A4F0 135 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM218A2RU14 115 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 RAG2P55895 527 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 HSD17B7P56937 341 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 C1orf220Q5T0J3 134 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 LRFN4Q6PJG9 635 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 METTL7AQ9H8H3 244 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 DLL4Q9NR61 685 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SIRT7Q9NRC8 400 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 GFRA2O00451 464 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 GABRG1Q8N1C3 465 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OR4K13Q8NH42 304 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CLMPQ9H6B4 373 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 GDE1Q9NZC3 331 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OR5K3A6NET4 321 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 GPR31O00270 319 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 NTSR1P30989 418 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 OR10A3P58181 314 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PLGLB1Q02325 96 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 RTP2Q5QGT7 225 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 NXPE4Q6UWF7 544 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TRILQ7L0X0 811 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CBLN2Q8IUK8 224 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ECHDC3Q96DC8 303 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CNIH4Q9P003 139 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF281Q9Y2X9 895 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PPV4 95 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM129A0AVI4 362 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CPEP16870 476 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PSMB6P28072 239 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 TACR3P29371 465 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CCKARP32238 428 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 RABIFP47224 123 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 DGCR2P98153 550 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 MANEAQ5SRI9 462 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 PRR27Q6MZM9 219 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 SLC18B1Q6NT16 456 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ETV3LQ6ZN32 361 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 KIRREL1Q96J84 757 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF681Q96N22 645 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 METTL9Q9H1A3 318 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 B4GALT7Q9UBV7 327 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 CLEC2DQ9UHP7 191 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 KCNK6Q9Y257 313 aa13.33□□□□□ -0.27
PTPRO-201ENST00000281171 USF1P22415 310 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms