RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 NSMAFQ92636 917 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 FGF13Q92913 245 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 RIT1Q92963 219 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 HIST1H2ACQ93077 130 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 MRI1Q9BV20 369 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SPACA6W5XKT8 324 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 EML5Q05BV3 1969 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 POM121CA8CG34 1229 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 CTNSO60931 367 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 PPM1BO75688 479 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 B3GALNT1O75752 331 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 GLCEO94923 617 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 RPP14O95059 124 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 S100A11P31949 105 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 PLA2G7Q13093 441 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 BTN1A1Q13410 526 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 C2orf68Q2NKX9 166 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ALKAL2Q6UX46 152 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 DNM1P46Q6ZS02 220 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 DNAAF1Q8NEP3 725 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OR10G6Q8NH81 332 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 COQ8AQ8NI60 647 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SEMA4CQ9C0C4 833 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SHARPINQ9H0F6 387 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 TCF7L1Q9HCS4 588 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ARPC3O15145 178 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ARPC5O15511 151 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SNAPC5O75971 98 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SIX6O95475 246 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 LPLP06858 475 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 MYOGP15173 224 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 RUNX3Q13761 415 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ENPP2Q13822 863 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 TMUB2Q71RG4 321 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 RD3Q7Z3Z2 195 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 CA13Q8N1Q1 262 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OR5M1Q8NGP8 315 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OR1E3Q8WZA6 343 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ARPC5LQ9BPX5 153 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 C12orf4Q9NQ89 552 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OPN4Q9UHM6 478 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ETV7Q9Y603 341 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 POM121BA6NF01 834 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SERPINI2O75830 405 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 GLSO94925 669 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 POU2F2P09086 479 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OR8G3PP0DMU2 310 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ITPKBP27987 946 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SOX2P48431 317 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 GPR143P51810 404 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 H2BFSP57053 126 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 Q499Y3 187 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 TANGO2Q6ICL3 276 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OVCH2Q7RTZ1 564 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ZNF550Q7Z398 422 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 LRRTM1Q86UE6 522 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ZNF511Q8NB15 262 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SCARB1Q8WTV0 552 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 FAM3CQ92520 227 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 Q96M85 177 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ALG12Q9BV10 488 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SLC6A17Q9H1V8 727 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ACTR10Q9NZ32 417 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SESN1Q9Y6P5 492 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 A0A087WUJ7 227 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 HMSDA8MTL9 139 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 GRXCR1A8MXD5 290 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 A8MXK9 166 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 UPK3AO75631 287 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 RP2O75695 350 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 PROS1P07225 676 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 IFI6P09912 130 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 PVRP15151 417 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 FCARP24071 287 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SLC6A19Q695T7 634 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 LEG1Q6P5S2 330 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 C15orf40Q8WUR7 153 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ST8SIA4Q92187 359 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SIPA1Q96FS4 1042 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 GINS4Q9BRT9 223 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 TWSG1Q9GZX9 223 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms