RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TXNDC15Q96J42 360 aa19.64■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MED18Q9BUE0 208 aa19.64■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 FNDC11Q9BVV2 318 aa19.64■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 NANSQ9NR45 359 aa19.64■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 V9GYQ6 96 aa19.64■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WUU8 490 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPR1 153 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 TCRBV5S2A0A599 114 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 KLF4O43474 513 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 HRGP04196 525 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 NQO1P15559 274 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 PPP3CBP16298 524 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 FUT1P19526 365 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 PUDPQ08623 228 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 FAPQ12884 760 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 BNIP1Q12981 228 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 TRAM2Q15035 370 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 TBPL2Q6SJ96 375 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 CYP2R1Q6VVX0 501 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 PXKQ7Z7A4 578 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 UBE2J2Q8N2K1 259 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 LURAP1Q96LR2 239 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 ASB6Q9NWX5 421 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MED31Q9Y3C7 131 aa19.63■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 hCG_2039718K7EN88 272 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 UPK3AO75631 287 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 OR7A10O76100 309 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 DIRAS1O95057 198 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 RHCEP18577 417 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 NIPAL3Q6P499 406 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 PGM2L1Q6PCE3 622 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 SGTBQ96EQ0 304 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 DHRS1Q96LJ7 313 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 RCE1Q9Y256 329 aa19.62■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 AKAP6Q13023 2319 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 ACOT8O14734 319 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 ADORA3P0DMS8 318 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MAKP20794 623 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 PRKCDQ05655 676 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 FHL1Q13642 323 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 C1DQ13901 141 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 TAB1Q15750 504 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 GABRA6Q16445 453 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 LCN8Q6JVE9 175 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 UEVLDQ8IX04 471 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 TMEM123Q8N131 208 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A13Q8TCU3 470 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MUS81Q96NY9 551 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 OR2M2Q96R28 347 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 FUZQ9BT04 418 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 THTPAQ9BU02 230 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 LINC00470Q9BZP3 86 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MED29Q9NX70 200 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R16Q9NYV7 291 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 NOX1Q9Y5S8 564 aa19.61■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRQ8 180 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 CASKO14936 926 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 AHCYP23526 432 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 IL32P24001 234 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 IFNA8P32881 189 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 DGCR6Q14129 220 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 PHYHD1Q5SRE7 291 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 NRMQ8IXM6 262 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 POMGNT2Q8NAT1 580 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 BTBD10Q9BSF8 475 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 EMC6Q9BV81 110 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MUC13Q9H3R2 512 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD19PQ9H560 264 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 IL1RAPQ9NPH3 570 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 ZNF226Q9NYT6 803 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 UPB1Q9UBR1 384 aa19.6■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 C11orf98E9PRG8 122 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 GOSR1O95249 250 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 IFI30P13284 250 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MPGP29372 298 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 C9orf135Q5VTT2 229 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 PODNL1Q6PEZ8 512 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 TMEM200AQ86VY9 491 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 CYP4Z1Q86W10 505 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 DHFR2Q86XF0 187 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 CDC20BQ86Y33 519 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B8Q92506 261 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 BPIFA2Q96DR5 249 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 ASB9Q96DX5 294 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 BOD1Q96IK1 185 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 PIP5K1AQ99755 562 aa19.59■□□□□ 0.73
SYF2-201ENST00000236273 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms