RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233468.4

SF3B6-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B6, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6-201ENST00000233468 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
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SF3B6-201ENST00000233468 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.97□□□□□ -0.81
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SF3B6-201ENST00000233468 RNF13O43567 381 aa9.97□□□□□ -0.81
SF3B6-201ENST00000233468 RAMP1O60894 148 aa9.97□□□□□ -0.81
SF3B6-201ENST00000233468 SLC43A1O75387 559 aa9.97□□□□□ -0.81
SF3B6-201ENST00000233468 OR7A10O76100 309 aa9.97□□□□□ -0.81
SF3B6-201ENST00000233468 ASAH2BP0C7U1 165 aa9.97□□□□□ -0.81
SF3B6-201ENST00000233468 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
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