RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202769.1

Trim54-202, Transcript of Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene Trim54, Length 1,408 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54-202ENSMUST00000202769 AprtP08030 180 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Syt4P40749 425 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Atp6v1b2P62814 511 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 SgcbP82349 320 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 HgfQ08048 728 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 B3gnt6Q3USF0 391 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr1028Q7TR89 324 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cadm2Q8BLQ9 435 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Fam46bQ8C152 427 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Panx3Q8CEG0 392 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 NaxeQ8K4Z3 282 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Dact1Q8R4A3 778 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr800Q8VFH7 311 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr1047Q8VGS0 319 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Dnase1l2Q9D1G0 278 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Izumo1rQ9EQF4 244 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Fads2Q9Z0R9 444 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Igkv4-63A0A0G2JFU6 117 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 4930595D18RikD3Z642 64 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 P2rx6O54803 389 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 GzmcP08882 248 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Copz1P61924 177 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Laptm5Q61168 261 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Slc6a15Q8BG16 729 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Foxj3Q8BUR3 623 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Endod1Q8C522 501 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ulbp1Q8HWA3 334 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rasgef1bQ8JZL7 473 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Eipr1Q8K0G5 386 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Vmn1r208Q8R275 308 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Vmn1r42Q8VBS7 329 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Serpinb9gQ8VHQ1 377 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Pcdh18Q8VHR0 1134 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Krcc1Q99JT5 256 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Emc4Q9CZX9 183 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Kat8Q9D1P2 458 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Mrpl19Q9D338 292 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tmem41aQ9D8U2 264 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Entpd4Q9DBT4 613 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Slc39a1Q9QZ03 324 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Syt11Q9R0N3 430 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Qrich2A0A140LIY9 2337 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm34653A0A1L1SR01 368 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Esp36G3UZD8 160 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 TspearJ3S6Y1 670 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm10479K7N6H4 105 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Vmn1r121K7N6J4 314 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 AldocP05063 363 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Apoa2P09813 102 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Hoxc5P32043 222 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Erp29P57759 262 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Fam20cQ5MJS3 579 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr463Q5SW49 311 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr462Q5SW50 311 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tff3Q62395 81 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ptpmt1Q66GT5 193 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Krr1Q8BGA5 380 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 C1ql2Q8CFR0 287 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Stk32cQ8QZV4 488 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Pofut2Q8VHI3 429 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Golm1Q91XA2 393 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Asb10Q91ZT7 467 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tcf19Q99KJ5 263 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Nkd1Q99MH6 471 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Mrps28Q9CY16 186 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Emc9Q9DB76 206 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cmya5Q70KF4 3739 aa14.61□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Trbv12-1A0A0B4J1H0 124 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm39566A0A1B0GT45 1251 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Zfp969A2ART2 485 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Zfp973A2BE20 318 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Igsf23B2RTN2 239 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Vmn1r184E9Q2N4 314 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm17728E9Q5K2 132 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr173E9QAT7 321 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm11397F6V5V4 377 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm20441G3UYJ7 252 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 3110021N24RikJ3QMN2 152 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Sh2b3O09039 548 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cd14P10810 366 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Atp1b1P14094 304 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gpx5P21765 221 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Impdh2P24547 514 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ccnb2P30276 398 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Kcnj12P52187 427 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 H3f3aP84244 136 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Msx2Q03358 267 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rspo3Q2TJ95 277 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Dcp1bQ3U564 578 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Nkain2Q4PNJ2 208 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr325Q5NCD2 326 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Sco1Q5SUC9 284 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rbbp4Q60972 425 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ube2j2Q6P073 259 aa14.6□□□□□ -0.07
Trim54-202ENSMUST00000202769 Serpinb9fQ80UK5 377 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 90.9 ms