RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171404.7

Gtf3c4-204, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c4, Length 7,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr1115Q7TR53 326 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Chpt1Q8C025 398 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Lyrm4Q8K215 91 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Commd1Q8K4M5 188 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Med6Q921D4 246 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Arhgap8Q9CXP4 425 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 LhppQ9D7I5 270 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Srpk3Q9Z0G2 565 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm11127A7VMS2 374 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm20715E9Q3L7 95 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Dusp5Q1HL35 384 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 N4bp2l1Q3V2Q8 238 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Six1Q62231 284 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 QdprQ8BVI4 241 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc38a2Q8CFE6 504 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr461Q8VF30 313 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rgs20Q9QZB1 239 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cacna1cQ01815 2139 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hs3st4D3YVV6 449 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Amy1P00687 511 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Nptx1Q62443 432 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr1275Q7TQY8 312 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Q80UB0 333 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gstm7Q80W21 218 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 2810021J22RikQ8BIB6 539 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Poglut1Q8BYB9 392 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 DrgxQ8BYH0 263 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 SowahcQ8C0J6 512 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc33a1Q99J27 550 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Naalad2Q9CZR2 740 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Lpar3Q9EQ31 354 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 IlkO55222 452 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Surf4Q64310 269 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ifna16Q810G1 189 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc30a8Q8BGG0 367 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Znf574Q8BY46 900 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc43a2Q8CGA3 568 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Obp1aQ9D3H2 163 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Clec1bQ9JL99 229 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Zfp142G5E869 1843 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm6096D3YTY6 151 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 BC048679D3YXE9 172 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr557E9Q550 322 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 H2-M1F7CXU4 344 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Bmp7P23359 430 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 AdprhP54923 362 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Fgf13P70377 245 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Fabp5Q05816 135 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Fbxo7Q3U7U3 523 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm853Q3UNZ2 425 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr1396Q7TQS8 315 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 NotumQ8R116 503 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rbms2Q8VC70 383 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Arpc5Q9CPW4 151 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Desi1Q9CQT7 168 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr587-ps1A0A1B0GSS1 159 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 mt-Co3P00416 261 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hexim2Q3TVI4 313 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr3Q60879 313 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tram1Q91V04 374 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tceal7A3KGA4 98 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Nr1h5E9Q5A6 505 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Wnt9bO35468 359 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 P01881 257 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 P01882 290 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Lancl2Q9JJK2 450 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ltn1Q6A009 1767 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ackr3P56485 362 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm7030Q0WXH6 285 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr146Q60884 306 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ranbp10Q6VN19 620 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr1045Q7TR80 315 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Dazap1Q9JII5 406 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 MiipA2A7Y5 387 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm10715J3QP74 227 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm3486L7N2D0 199 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Wdr5P61965 334 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Foxred1Q3TQB2 487 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 PcnpQ6P8I4 178 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Fads6Q80UG1 342 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc25a21Q8BZ09 298 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Yae1d1Q9DAY6 216 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Il1r1P13504 576 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Doc2bP70169 412 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr331Q5NC44 324 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olig3Q6PFG8 273 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Kmt5cQ6Q783 468 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Dtd2Q8BHA3 168 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Peli2Q8BST6 419 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slco4a1Q8K078 723 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hsd17b13Q8VCR2 304 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr361Q8VF16 322 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr985Q8VGB4 311 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 97.1 ms