RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm21103E9Q2Q1 267 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp934K7N6H3 473 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm8374L7N2A9 172 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MbpP04370 250 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gstm3P19639 218 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 EdnrbP48302 442 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ca10P61215 328 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Il9rQ01114 468 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kcnk6Q3TBV4 313 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc2a6Q3UDF0 497 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tas2r136Q7TQA8 305 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vtcn1Q7TSP5 283 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrfn4Q80XU8 636 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tnfsfm13Q8BXS2 410 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prkd2Q8BZ03 875 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc24a5Q8C261 501 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrrn3Q8CBC6 707 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 EfhbQ8CDU5 853 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Alg12Q8VDB2 486 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr811Q8VFI1 319 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr935Q8VG16 308 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr767Q8VG33 309 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr683Q8VGV1 319 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nop16Q9CPT5 178 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fank1Q9DAM9 344 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr2Q9QWU6 327 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lama3Q61789 3330 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 A0A286YDG0 184 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem182B2RVY9 229 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ItpkbB2RXC2 942 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr550E9Q544 316 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bet1O35623 118 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 BckdkO55028 412 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Spsb2O88838 264 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rfx3P48381 749 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Crybb2P62696 205 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dusp2Q05922 318 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nfatc2Q60591 927 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cyp1b1Q64429 543 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DgkzQ80UP3 929 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Atpaf1Q811I0 324 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam78aQ8C552 283 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kctd2Q8CEZ0 266 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc31a1Q8K211 196 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Defb19Q8K3I8 83 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr434Q8VF17 321 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1451Q8VFX5 310 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1238Q8VG59 315 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1280Q8VGG8 305 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1054Q8VGS7 312 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr649Q8VGW1 312 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmprss11dQ8VHK8 417 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 F11Q91Y47 624 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dda1Q9D9Z5 102 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr934Q9EQ87 310 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 FetubQ9QXC1 388 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Clcf1Q9QZM3 225 aa8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arpc1bQ9WV32 372 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ajap1A2ALI5 412 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1055A2AVX9 346 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tas2r122D3YU55 309 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr619E9PV95 320 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm20431E9PY39 371 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fcn1O70165 334 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cnr1P47746 473 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp41Q02526 198 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sox8Q04886 464 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gpr15Q0VDU3 360 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd84Q18PI6 329 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc39a7Q31125 476 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pced1aQ6P1Z5 449 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Klhl9Q6ZPT1 617 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Scn4bQ7M729 228 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1349Q7TQV1 317 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr43Q7TRX1 313 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr403Q7TRX2 313 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 IqcjQ8BPW0 110 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr435Q8VFS3 313 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr339Q8VGK8 309 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CsprsQ99388 208 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lamp5Q9D387 280 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RhagQ9QUT0 438 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1025-ps1A0A140T8K3 312 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ndor1A2AI05 598 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rex2A2AWF2 685 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd101A8E0Y8 1033 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Scgb2b3D2XZ38 112 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm5458L7N219 204 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Stxbp1O08599 594 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gpr33O88416 339 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sypl2O89104 264 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ArafP04627 604 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pcgf2P23798 342 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Alox5apP30355 161 aa8.63□□□□□ -1.03
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kcng3P59053 433 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.3 ms