RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HLA-B-257ENST00000640094 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HLA-B-257ENST00000640094 YIPF5Q969M3 257 aa7.4□□□□□ -1.22
HLA-B-257ENST00000640094 FMO2Q99518 471 aa7.4□□□□□ -1.22
HLA-B-257ENST00000640094 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.4□□□□□ -1.22
HLA-B-257ENST00000640094 RASD1Q9Y272 281 aa7.4□□□□□ -1.22
HLA-B-257ENST00000640094 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.4□□□□□ -1.22
HLA-B-257ENST00000640094 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.4□□□□□ -1.22
HLA-B-257ENST00000640094 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 A0A096LPI6 279 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1B0GUS0 222 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 TIMM23O14925 209 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 FRS3O43559 492 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 UPK3AO75631 287 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 RAB36O95755 333 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 MT-ND5P03915 603 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 CHRM4P08173 479 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 CXCR1P25024 350 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 COL8A2P25067 703 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 RAD52P43351 418 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 DNAJB13P59910 316 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 HBA1P69905 142 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 KCNJ10P78508 379 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 MVKQ03426 396 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PTGR1Q14914 329 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 MAPK14Q16539 360 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 LINGO2Q7L985 606 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 SNX32Q86XE0 403 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ST7LQ8TDW4 575 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 UBE2FQ969M7 185 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 DUX5Q96PT3 197 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 GAL3ST1Q99999 423 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 DUSP26Q9BV47 211 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 OR51I1Q9H343 314 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 MID2Q9UJV3 735 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 NUP50Q9UKX7 468 aa7.39□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 CFAP73A6NFT4 308 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 A8MVM7 634 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PPIAL4DF5H284 164 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 AP3D1O14617 1153 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 AHSA1O95433 338 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 KNG1P01042 644 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ABHD2P08910 425 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 LINC00032P0C843 101 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF43P17038 809 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PRPS1L1P21108 318 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 MTNR1AP48039 350 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 CLDN17P56750 224 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 GSTA3Q16772 222 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC153Q494R4 210 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 GPAT3Q53EU6 434 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 FAM209AQ5JX71 171 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 AVPI1Q5T686 147 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 AP1ARQ63HQ0 302 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 KANK2Q63ZY3 851 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 BRICD5Q6PL45 260 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 SPATC1Q76KD6 591 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC63Q8NA47 563 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 RAB1CQ92928 201 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 ROPN1LQ96C74 230 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 LRRC58Q96CX6 371 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 GPR35Q9HC97 309 aa7.38□□□□□ -1.23
HLA-B-257ENST00000640094 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.38□□□□□ -1.23
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