RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF23	P17027	643 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	MAP2K6	P52564	334 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	TRIP10	Q15642	601 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	OGFOD2	Q6N063	350 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	RNF217	Q8TC41	542 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	MAL2	Q969L2	176 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	VPS33A	Q96AX1	596 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	SNX18	Q96RF0	628 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	PLK3	Q9H4B4	646 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CRLF2	Q9HC73	371 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HAO1	Q9UJM8	370 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM129	A0AVI4	362 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078		M0R3G1	203 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	NPIPB7	O75200	414 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	SLC22A3	O75751	556 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	C8B	P07358	591 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	ADRA2A	P08913	450 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF43	P17038	809 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	NPR2	P20594	1047 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CRISP3	P54108	245 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	AQP5	P55064	265 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	EGR4	Q05215	589 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	PIGF	Q07326	219 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CCNI	Q14094	377 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	ADRM1	Q16186	407 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	MDP1	Q86V88	176 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CDK20	Q8IZL9	346 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	DOK1	Q99704	481 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	GPR35	Q9HC97	309 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078		M0R082	166 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HDAC3	O15379	428 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	LILRA1	O75019	489 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	VAMP5	O95183	116 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	IGLV1-44	P01699	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CBR1	P16152	277 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HNF1A	P20823	631 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	EFNB3	Q15768	340 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	BOD1	Q96IK1	185 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0G2JPF8	293 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	SLC43A1	O75387	559 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF432	O94892	652 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HLA-H	P01893	362 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	IL6	P05231	212 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	CD79A	P11912	226 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	HLA-DOB	P13765	273 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	IFNGR1	P15260	489 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	PPOX	P50336	477 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	MSMP	Q1L6U9	139 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	RNF220	Q5VTB9	566 aa		11.67	□□□□□ -0.54

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