RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	VAT1	Q99536	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440		E5RI56	91 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	IMPA2	O14732	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	EFNA2	O43921	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFS3	O75489	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SCEL	O95171	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF205	O95201	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CNIH1	O95406	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	IFNA4	P05014	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	NR2F6	P10588	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMA3	P25788	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CTNNA2	P26232	953 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS6	P49758	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KLRD1	Q13241	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	RASA2	Q15283	850 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GBA3	Q9H227	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PLPP1	O14494	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	APOL1	O14791	398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TGOLN2	O43493	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LCK	P06239	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	HTR5A	P47898	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	DIO1	P49895	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CLRN1	P58418	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAME	P78395	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CUL1	Q13616	776 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TFDP2	Q14188	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZR54	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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