RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPEG	Q15772	3267 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTPRD	P23468	1912 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525		H3BN98	237 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCDH17	O14917	1159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CASK	O14936	926 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SULT1B1	O43704	296 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VEGFD	O43915	354 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR10H3	O60404	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDRT1	O95170	752 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TGM6	O95932	706 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SOD1	P00441	154 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LHCGR	P22888	699 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC6A1	P30531	599 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HBA1	P69905	142 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD300C	Q08708	224 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DMPK	Q09013	629 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74	6e-7	■■■□□ 18.4
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAE1	Q13564	534 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRT33B	Q14525	404 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAM2	Q15035	370 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BAK1	Q16611	211 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ELMO1	Q92556	727 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPR137	Q96N19	417 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HBEGF	Q99075	208 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MED28	Q9H204	178 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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