RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	CARTPT	Q16568	116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	EPGN	Q6UW88	154 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ELOA3	Q8NG57	546 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	EBF4	Q9BQW3	602 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A096LPI6	279 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	HPR	P00739	348 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ARAF	P10398	606 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	BMP2	P12643	396 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC25A16	P16260	332 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	AQP1	P29972	269 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	DSCR9	P59020	149 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	VLDLR	P98155	873 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	IL1RL1	Q01638	556 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	BBS10	Q8TAM1	723 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	STK35	Q8TDR2	534 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	CA10	Q9NS85	328 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	IFT52	Q9Y366	437 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	C5orf58	C9J3I9	102 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF432	O94892	652 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	HLA-DOB	P13765	273 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	GRPR	P30550	384 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	IDH3A	P50213	366 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC18A1	P54219	525 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	STX1B	P61266	288 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	NAAA	Q02083	359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	HGFAC	Q04756	655 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	CHRNB3	Q05901	458 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	ADIPOQ	Q15848	244 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	RNF217	Q8TC41	542 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	CHODL	Q9H9P2	273 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	NOX3	Q9HBY0	568 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC35F4	A4IF30	521 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	LRRN3	E7EW58	273 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	VAMP5	O95183	116 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	IGLV1-44	P01699	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	OR4A8	P0C604	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	BMP4	P12644	408 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF43	P17038	809 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	IGFBP5	P24593	272 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	SERPINF1	P36955	418 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	CDK6	Q00534	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	NPRL3	Q12980	569 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	FADD	Q13158	208 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	MDP1	Q86V88	176 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FCHO1-233	ENST00000600393	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62

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