RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM129A0AVI4 362 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 VSTM5A8MXK1 200 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 FTCDNL1E5RQL4 147 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF432O94892 652 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT75O95678 551 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PNMTP11086 282 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PRG2P13727 222 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NPR2P20594 1047 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MVDP53602 400 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CRISP3P54108 245 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CDH15P55291 814 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CLDN17P56750 224 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 VSNL1P62760 191 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RIN1Q13671 783 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ADRM1Q16186 407 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF220Q5VTB9 566 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA21Q7Z572 469 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 KDM8Q8N371 416 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PTDSS2Q9BVG9 487 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CALML5Q9NZT1 146 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RCE1Q9Y256 329 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SDHDO14521 159 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RFXANKO14593 260 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TM9SF1O15321 606 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 FZD7O75084 574 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC43A1O75387 559 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 AHSA1O95433 338 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 BCHEP06276 602 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ETFAP13804 333 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF43P17038 809 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ARR3P36575 388 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 EGR4Q05215 589 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NPRL3Q12980 569 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIP10Q15642 601 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINA11Q86U17 422 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CDK20Q8IZL9 346 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 OXGR1Q96P68 337 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NOX3Q9HBY0 568 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR35Q9HC97 309 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PNPOQ9NVS9 261 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 ADRA2AP08913 450 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNGR1P15260 489 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 BGNP21810 368 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 PCMT1P22061 227 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 CRATP43155 626 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 DSTNP60981 165 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 IL1RL1Q01638 556 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 STX3Q13277 289 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNIQ14094 377 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 DAG1Q14118 895 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 ATG16L1Q676U5 607 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT80Q6KB66 452 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 RINLQ6ZS11 566 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 MDP1Q86V88 176 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM19Q96HH6 336 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms