RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-210ENST00000580799 TUBA1BP68363 451 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 TUBA4AP68366 448 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 BNIP2Q12982 314 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 SCGB2A2Q13296 93 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 RIN1Q13671 783 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 ADRM1Q16186 407 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 COX20Q5RI15 118 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 TUBA1AQ71U36 451 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 SPATA21Q7Z572 469 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 VRK2Q86Y07 508 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 SVOPLQ8N434 492 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 SLC35B4Q969S0 331 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 TEX37Q96LM6 180 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 SNX18Q96RF0 628 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 ZBTB18Q99592 522 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 NUF2Q9BZD4 464 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 METRNQ9UJH8 293 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-210ENST00000580799 A0A0G2JPF8 293 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 WDR91A4D1P6 747 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 TMEM247A6NEH6 219 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 B4DSR2 109 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 RFXANKO14593 260 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 TM9SF1O15321 606 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 FZD7O75084 574 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SLC43A1O75387 559 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 ZNF432O94892 652 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 BCHEP06276 602 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 GSNP06396 782 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 PNMTP11086 282 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 IFNGR1P15260 489 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 ITGA2P17301 1181 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 IL2RGP31785 369 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 CDKN2CP42773 168 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 EVX1P49640 407 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 CLDN17P56750 224 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 DAG1Q14118 895 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 MAPK11Q15759 364 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 OXGR1Q96P68 337 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SORT1Q99523 831 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 AIG1Q9NVV5 245 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 USP22Q9UPT9 525 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 IFT52Q9Y366 437 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 CMAHPQ9Y471 501 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 TMEM129A0AVI4 362 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 M0R233 179 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 SYNGR3O43761 229 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 OR2T1O43869 369 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 IL6P05231 212 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 CELA3BP08861 270 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 ADRA2AP08913 450 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 PRG2P13727 222 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 ETFAP13804 333 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 CRATP43155 626 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 MVDP53602 400 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 NME5P56597 212 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 DSTNP60981 165 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 RUNX1T1Q06455 604 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 NPRL3Q12980 569 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 ATG16L1Q676U5 607 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 REP15Q6BDI9 236 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 DEF8Q6ZN54 512 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-210ENST00000580799 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms