RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 OR52N5Q8NH56 324 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 CSPG4Q6UVK1 2322 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 OVOL3O00110 214 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SLC22A2O15244 555 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 CD40P25942 277 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ATP5J2P56134 94 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 NRF1Q16656 503 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 NANOGP8Q6NSW7 305 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 EPHX4Q8IUS5 362 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SCAIQ8N9R8 606 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 OR10A6Q8NH74 314 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SLC26A7Q8TE54 656 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 TAAR8Q969N4 342 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ARHGDIGQ99819 225 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ECSITQ9BQ95 431 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ALG2Q9H553 416 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 NANOGQ9H9S0 305 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 FKRPQ9H9S5 495 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF446Q9NWS9 450 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 GID8Q9NWU2 228 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 NPAP1Q9NZP6 1156 aa15.94■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SHISA9B4DS77 424 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 FBP2O00757 339 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF83P51522 516 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 CDH11P55287 796 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 KLF10Q13118 480 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 DUSP7Q16829 419 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 VMACQ2NL98 169 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 AGAP6Q5VW22 663 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 NIPAL3Q6P499 406 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ERICH5Q6P6B1 374 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC80Q76M96 950 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 DTX2Q86UW9 622 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 COMTD1Q86VU5 262 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 WDR31Q8NA23 367 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SMYD1Q8NB12 490 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 RNF217Q8TC41 542 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 LRRC58Q96CX6 371 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SLC41A3Q96GZ6 507 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 Q96MF0 132 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 MCHR1Q99705 422 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ASPNQ9BXN1 380 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SAR1AQ9NR31 198 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 KLHL14Q9P2G3 628 aa15.93■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ALPK2Q86TB3 2170 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 M0R082 166 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SLC43A1O75387 559 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 MT-ATP6P00846 226 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 IFNA14P01570 189 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SOD3P08294 240 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 GRPRP30550 384 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SELENOPP49908 381 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 CDH12P55289 794 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 VEZF1Q14119 521 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SELPLGQ14242 412 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SLC22A25Q6T423 547 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF417Q8TAU3 575 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 MPP4Q96JB8 637 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 AP3M1Q9Y2T2 418 aa15.92■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 M0R1B8 84 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 MRASO14807 208 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ATP8B1O43520 1251 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 CHP2O43745 196 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 TPST2O60704 377 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF432O94892 652 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 NQO1P15559 274 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 GZMMP51124 257 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 CLDN17P56750 224 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 PGGHGQ32M88 737 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 C3orf36Q3SXR2 165 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF544Q6NX49 715 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 UEVLDQ8IX04 471 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 PIK3C3Q8NEB9 887 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 NEUROG1Q92886 237 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 PRR14Q9BWN1 585 aa15.91■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 SLC19A3Q9BZV2 496 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms