RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CDS2O95674 445 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 OR10A3P58181 314 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 EXT1Q16394 746 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 MEP1AQ16819 746 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 GPAT4Q86UL3 456 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 FRG2Q64ET8 278 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 FGGYQ96C11 551 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 DDA1Q9BW61 102 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 PRRC1Q96M27 445 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 SNX10Q9Y5X0 201 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 DOCK1Q14185 1865 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CDC14CA4D256 554 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 PTGFRP43088 359 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 GPX6P59796 221 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PARM1Q6UWI2 310 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PDZD3Q86UT5 571 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF100Q8IYN0 542 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TOMM40LQ969M1 308 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ADAP2Q9NPF8 381 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OSER1Q9NX31 292 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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