RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TAPBPO15533 448 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RFPL3O75679 317 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 GAAP10253 952 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SYPL1Q16563 259 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MED25Q71SY5 747 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SYT13Q7L8C5 426 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 OR13H1Q8NG92 308 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TAAR8Q969N4 342 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CYC1P08574 325 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 IL2RGP31785 369 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MBTPS1Q14703 1052 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 UGT8Q16880 541 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 VASNQ6EMK4 673 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MALSU1Q96EH3 234 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 FKRPQ9H9S5 495 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 WNT16Q9UBV4 365 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PPC4 97 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 FRG2CA6NGY1 282 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 GABRPO00591 440 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CLIC3O95833 236 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 T-ENOLP0DO92 83 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 GLB1P16278 677 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CA5AP35218 305 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 PNLIPRP2P54317 469 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF91Q05481 1191 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 GALNT10Q86SR1 603 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SGCZQ96LD1 299 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 OR14A2Q96R54 314 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TSPAN15O95858 294 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 KLKB1P03952 638 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 PSMB5P28074 263 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 HTR2CP28335 458 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CHRNEQ04844 493 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 C3orf30Q96M34 536 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 OR51J1Q9H342 316 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RFX2P48378 723 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 DNASE1L3Q13609 305 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 PLA1AQ53H76 456 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TSSK4Q6SA08 328 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 APH1AQ96BI3 265 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CSF3RQ99062 836 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CHST11Q9NPF2 352 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 C5AR2Q9P296 337 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 DAPP1Q9UN19 280 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 UBL3O95164 117 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CD22P20273 847 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CD1CP29017 333 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R30P59541 319 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RAB11AP62491 216 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MAP4K2Q12851 820 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 THEM4Q5T1C6 240 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 OR56B4Q8NH76 319 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 C17orf50Q8WW18 174 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 STARD5Q9NSY2 213 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms