RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 OR9K2Q8NGE7 335 aa4.96□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 LRR1Q96L50 414 aa4.96□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00470Q9BZP3 86 aa4.96□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 OR11A1Q9GZK7 315 aa4.96□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 CXXC4Q9H2H0 198 aa4.96□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNN2Q9H2S1 579 aa4.96□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.96□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa4.96□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.96□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.96□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GX12 115 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM229AB2RXF0 380 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 RNF13O43567 381 aa4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 RAD51DO75771 328 aa4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 AKR7A3O95154 331 aa4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 ITGA2P17301 1181 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 COX5AP20674 150 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 AHCYP23526 432 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 PRDX6P30041 224 aa4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 SMIM11AP58511 58 aa4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 ADRM1Q16186 407 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 REP15Q6BDI9 236 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF544Q6NX49 715 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 NIPAL3Q6P499 406 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD16Q6P6B7 361 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC22A25Q6T423 547 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC103Q8IW40 242 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM99Q8N816 258 aa4.95□□□□□ -1.62
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CLSTN3-215ENST00000544584 FNDC8Q8TC99 324 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 MUS81Q96NY9 551 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 NPAS1Q99742 590 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 LRMDAQ9H2I8 198 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 SAR1AQ9NR31 198 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR160Q9UJ42 338 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 POFUT2Q9Y2G5 429 aa4.95□□□□□ -1.62
CLSTN3-215ENST00000544584 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.95□□□□□ -1.62
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