RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC43A2Q8N370 569 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PACRGLQ8N7B6 248 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM86B1Q8N7N1 296 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF563Q8TA94 476 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNE4Q8WWG9 221 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGF11Q92914 225 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC38A4Q969I6 547 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRRC1Q96M27 445 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPYCQ99645 322 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCHR1Q99705 422 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC29A1Q99808 456 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGDIGQ99819 225 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ASCL3Q9NQ33 180 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLRF1Q9NZS2 232 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIMS3Q9UJD0 308 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MED13Q9UHV7 2174 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0U1RQK1 487 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1W2PQ72 361 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF320A2RRD8 509 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDHR4A6H8M9 788 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF264O43296 627 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCO2O43819 266 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SSX5O60225 188 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR2J2O76002 312 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DIRAS1O95057 198 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCNB2O95067 398 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGKV1D-16P01601 117 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEMG1P04279 462 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NGFRP08138 427 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MED14OSP0DP75 135 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THRBP10828 461 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITGAMP11215 1152 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRG2P13727 222 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PGCP20142 388 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNFRSF1BP20333 461 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITPKBP27987 946 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCR4P51679 360 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAD23AP54725 363 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP2R2BQ00005 443 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCRN3Q0VDG4 424 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPS8Q12929 822 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHAF1BQ13112 559 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP1A4Q13733 1029 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CBFBQ13951 182 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GANABQ14697 944 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAM2Q15035 370 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZMYND11Q15326 602 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RFX4Q33E94 735 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C6orf183Q5T699 404 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF555Q8NEP9 628 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GIPC3Q8TF64 312 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZG16BQ96DA0 208 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPH1Q9BZG8 443 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAT2Q9GZY6 243 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LHPPQ9H008 270 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COQ10BQ9H8M1 238 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STMN3Q9NZ72 180 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNIH4Q9P003 139 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 U3KQV3 271 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEP250Q9BV73 2442 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARGFXA6NJG6 315 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AHRRA9YTQ3 701 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H0YJX3 145 aa5.11□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.9 ms