RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSD17B3P37058 310 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL10A1Q03692 680 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLCQ05315 142 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD69Q07108 199 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6YL49 198 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRINAQ7Z429 371 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGN2P46Q86SG4 172 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDIT4LQ96D03 193 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STACQ99469 402 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOR3AQ9H497 397 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC189A1A4V9 331 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7EIL1 84 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TP73O15350 636 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR137BO60478 399 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJA2O60884 412 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUPT7LO94864 414 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R3DO95685 299 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MELTFP08582 738 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFI6P09912 130 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELENOVP59797 346 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAX8Q06710 450 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TP53BP2Q13625 1128 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RASA2Q15283 850 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FXNQ16595 210 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IMPG1Q17R60 797 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSG1Q2KHT4 349 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMEL1Q495T6 779 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM8Q8N371 416 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHF21AQ96BD5 680 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPCDCQ96CD2 204 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIRC2Q96SL1 478 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR160Q9UJ42 338 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MKLN1Q9UL63 735 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMX2A2RU54 273 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AQP7P3A6NL99 342 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPRY3O43610 288 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCMRO60667 390 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPIP06744 558 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBP1P09455 135 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC6A9P48067 706 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN17P56750 224 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERVS71-1P61550 626 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GUCY2DQ02846 1103 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EGR3Q06889 387 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX35Q5T0J7 233 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZSV7 163 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYG1Q8N1E2 194 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDF2Q99470 211 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR35Q9HC97 309 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMCO1Q9UM00 188 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX24Q9Y343 169 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A8MT66 165 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT2B17O75795 530 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TGDSO95455 350 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCKP06239 509 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRM4P08173 479 aa8.56□□□□□ -1.04
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